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《條例》明確，生態(tài)保護(hù)補(bǔ)償應(yīng)遵循政府主導(dǎo)、企業(yè)和社會參與、市場化運作、可持續(xù)的原則。縣級以上人民政府通過財政轉(zhuǎn)移支付等方式，對森林、濕地、海洋、漁業(yè)、耕地等重點領(lǐng)域和國家公園等重點生態(tài)區(qū)域內(nèi)承擔(dān)生態(tài)保護(hù)責(zé)任的有關(guān)單位和個人按照規(guī)定給予補(bǔ)償。在規(guī)定的補(bǔ)償范圍之外，市、縣、自治縣人民政府可根據(jù)本地區(qū)生態(tài)功能定位、本級財力狀況等因素擴(kuò)大生態(tài)保護(hù)補(bǔ)償范圍和提高補(bǔ)償標(biāo)準(zhǔn)?！稐l例》分別對森林、濕地、海洋、漁業(yè)、耕地等重點領(lǐng)域設(shè)置了專門條款，進(jìn)一步細(xì)化和完善了重要生態(tài)系統(tǒng)的補(bǔ)償政策，并對各領(lǐng)域生態(tài)保護(hù)補(bǔ)償范圍、主體、考量因素、主管部門責(zé)任以及激勵與約束機(jī)制作了詳細(xì)規(guī)定?！稐l例》特別設(shè)置了海洋生態(tài)保護(hù)補(bǔ)償條款，將海灣、河流入海口、海島、灘涂等重點海洋生態(tài)系統(tǒng)納入補(bǔ)償范圍，同時以列舉的方式，明確了國家公園等生態(tài)保護(hù)補(bǔ)償重點生態(tài)區(qū)域。
《條例》提出，在政府主導(dǎo)型生態(tài)保護(hù)補(bǔ)償基礎(chǔ)上，采取區(qū)域間合作、市場交易等多元補(bǔ)償方式。一方面，鼓勵生態(tài)受益地區(qū)與生態(tài)保護(hù)地區(qū)通過簽訂生態(tài)保護(hù)補(bǔ)償協(xié)議，開展橫向生態(tài)保護(hù)補(bǔ)償活動。另一方面，推動建立市場化生態(tài)保護(hù)補(bǔ)償機(jī)制，逐步推進(jìn)市場化交易補(bǔ)償。包括建立綠色產(chǎn)品標(biāo)識、綠色金融、綠色采購等激勵機(jī)制，促進(jìn)生態(tài)產(chǎn)品價值實現(xiàn)；推進(jìn)海南省水資源使用權(quán)確權(quán)工作，鼓勵水權(quán)人通過節(jié)約使用水資源有償轉(zhuǎn)讓相應(yīng)取水權(quán)，獲得相應(yīng)補(bǔ)償；探索碳排放權(quán)交易補(bǔ)償模式，逐步構(gòu)建以碳排放權(quán)抵消機(jī)制為核心的交易機(jī)制等?！稐l例》按照《海南自由貿(mào)易港建設(shè)總體方案》中關(guān)于生態(tài)保護(hù)補(bǔ)償機(jī)制建設(shè)的要求，確立企業(yè)社會參與的基本原則，并在進(jìn)一步明確各級政府及其相關(guān)部門在生態(tài)保護(hù)補(bǔ)償方面的職責(zé)、嚴(yán)格規(guī)范政府行為的基礎(chǔ)上，貫徹環(huán)境共治理念，注重引導(dǎo)、發(fā)揮社會主體參與生態(tài)保護(hù)補(bǔ)償?shù)闹匾饔?。《條例》提出，鼓勵社會主體主動開展海洋生態(tài)保護(hù)活動，鼓勵社會力量參與生態(tài)保護(hù)補(bǔ)償活動等。
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