蛋白質(zhì)組學
proteomics
定義:闡明生物體各種生物基因組在細胞中表達的全部蛋白質(zhì)的表達模式及功能模式的學科。包括鑒定蛋白質(zhì)的表達、存在方式(修飾形式)、結(jié)構(gòu)、功能和相互作用等。
學科:醫(yī)學遺傳學_醫(yī)學遺傳學基礎(chǔ)_總論
相關(guān)名詞:蛋白質(zhì) 電泳 質(zhì)譜
圖片來源:視覺中國
【延伸閱讀】
蛋白質(zhì)組學是研究蛋白質(zhì)的組成、結(jié)構(gòu)、功能、加工、修飾以及蛋白質(zhì)間相互作用等的學科,是生物學和生物化學領(lǐng)域中的一個重要分支。蛋白質(zhì)是生命活動的主要執(zhí)行者,也是生物體性狀的最直接反映?;蛑笇У鞍踪|(zhì)合成,但翻譯后修飾的蛋白質(zhì)水平無法用轉(zhuǎn)錄水平進行分析,因此需要蛋白質(zhì)組學技術(shù)對蛋白質(zhì)進行定量和定性分析。
蛋白質(zhì)組學研究主要有三方面:表達蛋白質(zhì)組學、結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)組學和功能蛋白質(zhì)組學。表達蛋白質(zhì)組學用于細胞內(nèi)蛋白表達的定量研究;結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)組學研究的是蛋白復合物的結(jié)構(gòu),以及存在于特定細胞器中的蛋白質(zhì);功能蛋白質(zhì)組學以細胞內(nèi)蛋白質(zhì)的功能及蛋白質(zhì)之間的相互作用為研究目的,對選定的蛋白質(zhì)組進行研究和描述。
蛋白質(zhì)組學分析常用基于二維凝膠電泳和基于質(zhì)譜兩種方法。二維凝膠電泳(2DE或2D-PAGE)是最早開發(fā)的蛋白質(zhì)組學技術(shù),根據(jù)蛋白質(zhì)的電荷(第一維)和相對分子質(zhì)量(第二維)在凝膠中分離?,F(xiàn)在,基于二維凝膠電泳的方法常被用來分離蛋白質(zhì)。隨著質(zhì)譜技術(shù)的發(fā)展產(chǎn)生了基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學。該技術(shù)可以對每個樣品的多個蛋白質(zhì)進行高通量鑒定。
蛋白質(zhì)混合物通過質(zhì)譜儀進行分析,主要包括以下兩種技術(shù):1.MALDI-TOF-MS(基質(zhì)輔助激光解析電離飛行時間質(zhì)譜),通過基質(zhì)的作用將蛋白質(zhì)分子轉(zhuǎn)化為離子,然后利用離子飛行時間的差異來確定蛋白質(zhì)的分子量;2.LC-MS/MS(液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜),通過液相色譜將蛋白質(zhì)混合物進行分離,然后將分離得到的蛋白質(zhì)逐一離子化,并在串聯(lián)質(zhì)譜儀中進行碎片分析,從而確定蛋白質(zhì)的氨基酸序列和修飾情況?;谫|(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學具有高靈敏度、高分辨率、高通量等優(yōu)點,可以同時分析大量蛋白質(zhì)的表達和修飾情況,廣泛應(yīng)用于生物醫(yī)學研究、藥物發(fā)現(xiàn)等領(lǐng)域。
蛋白質(zhì)組學可以定性與定量分析蛋白質(zhì),與基因組學、生物信息學等學科進行交叉分析,形成系統(tǒng)生物學研究模式,對了解全面的基因表達起到重要作用。蛋白質(zhì)組學的發(fā)展將對疾病治療、疫苗研制等方面產(chǎn)生進一步的影響。
(延伸閱讀作者:東北師范大學生命科學學院 李寧博士)
責任編輯:張鵬輝